Zmagovalec 24 krogov dolge dirke razreda MotoGP v Motegiju je z novo odlično predstavo postal tovarniški dirkač Ducatija Marc Marquez. Za zmago se je danes moral vseeno potruditi precej bolj kot na sobotnem Sprintu, saj je tokrat vodstvo prevzel tik pred prehodom v drugo polovico preizkušnje ter ob koncu slavil s prednostjo 1.3s pred konkurenco. Najhitrejši po kvalifikacijah in vodilni v prvi polovici dirke, tovarniški dirkač Aprilie Jorge Martin, se je tako moral zadovoljiti s končnim drugim mestom, ekipni uspeh tovarniškega moštva iz Noaleja pa je s tretjim mestom dopolnil Marco Bezzecchi, ki je za zmagovalcem zaostal 2.2s.

Tik za njim, oba dirkača je na ciljni črti ločilo le 0.078s, je na nehvaležnem četrtem mestu dirko zaključil dirkač ekipe Tech3 KTM Enea Bastianini, ki je v zadnjih krogih navduševal s serijo daleč najhitrejših krogov, a to ni bilo dovolj da bi se povzpel na zmagovalni oder. Peto mesto, več kot 12s za dominantno četverico spredaj, je osvojil španski dirkač ekipe Trackhouse Raul Fernandez, medtem ko je njegov moštveni kolega, domačin Ai Ogura, dirko končal tik za njim na končnem šestem mestu.

Na končnem sedmem mestu je tokrat, potem ko je v zadnjih krogih popustil za obema dirkačema ekipe Trackhouse, dirko zaključil tovarniški KTM dirkač Pedro Acosta, na osmem mestu pa je dirko zaključil drugi Ducatijev tovarniški dirkač Francesco Bagnaia v precej boljši predstavi kot predtem v celotnem vikendu. Dirkač ekipe Gresini Ducati Fermin Aldeguer je preizkušnjo sklenil na končnem devetem mestu, prvo deseterico pa je na domači dirki za Hondo, ki se je s posebno poslikavo poklonila tudi legendarni RC181, zaključil tovarniški dirkač Luca Marini.

Tovarniški KTM dirkač Brad Binder je zadnjo japonsko preizkušnjo pred selitvijo v prvenstvo Superbike s koncem letošnje sezone sklenil na končnem enajstem mestu, na dvanajstem pa je dirko zaključil najboljši predstavnik Yamahe Fabio Quartararo. Somkiat Chantra, ki je v tovarniški Hondini ekipi zamenjal obolelega Joana Mira, je dirko z zelo solidno predstavo sklenil na končnem trinajstem mestu, do štirinajstega mesta pa se je v prvi dirki po dolgotrajni odsotnosti uspel prebiti drugi dirkač ekipe Tech3 KTM Maverick Vinales. Zadnjo točko za končno petnajsto mesto je osvojil dirkač ekipe VR46 Ducati Franco Morbidelli.